کیفیت بهداشتی شیر یکی از چالش‌های مهم در صنعت لبنیات ایران است و ارتباط مستقیم با سلامت مصرف‌کننده، قیمت فروش و سودآوری گله دارد.                                                      

دامپروری مدرن از یک فعالیت تجربه‌محور به یک سامانه داده‌محور و ژنتیک‌محور تبدیل شده است.                                                                                                                                              

صنعت دامپروری در دهه‌های اخیر با چالش‌های متعددی در زمینه بهره‌وری، رفاه حیوانی، مدیریت تغذیه، بهداشت و فناوری‌های نوین مواجه بوده است.                                                       

بهبود ژنتیکی گاوهای شیری Holstein نقش مؤثری در ارتقاء تولید شیر و صفات اقتصادی–تولیدی دارد. در سال‌های اخیر پیشرفت‌های چشمگیر در روش‌های ژنومی و مطالعات گسترده‌ی ارتباط ژنوتیپ–فنوتیپ امکان شناسایی و انتخاب مؤثر تر صفات پیچیده ـ مانند میزان شیر، چربی و پروتئین ـ را فراهم کرده است.